Арсенал
В матчах за «Арсенал» Аршавин дебютировал 21 февраля 2009 года в домашнем поединке с «Сандерлендом» (0:0).

14 марта 2009 года в матче английской Премьер-Лиги против «Блэкберна» на 65-й минуте Андрей забил свой первый гол за «Арсенал». В первом тайме Аршавин получил повреждение в результате столкновения с защитником «Блэкберна» Ойером, из-за чего в перерыве ему наложили восемь швов[3]. Несмотря на это, Аршавин вышел на второй тайм и открыл счёт своим голам за «Арсенал».

21 апреля 2009 года забил 4 гола в гостевом матче английской Премьер-лиги против «Ливерпуля», оформив тем самым свой первый за карьеру покер. Аршавин стал первым игроком, которому удалось сделать покер на стадионе «Энфилд Роуд» в рамках чемпионата Англии за последние 63 года[4]. Игра завершилась со счетом 4:4.
Андрей Аршавин подаёт угловой в матче «Арсенал» — «Мидлсбро» 26 апреля 2009 года.

2 мая 2009 года против «Портсмута» вышел полурезервный состав «Арсенала», так как через три дня команде предстоял ответный матч полуфинала Лиги чемпионов. Аршавин не участвовал в этом матче, поскольку в Лиге чемпионов он уже был заигран за «Зенит» и не имел права сыграть с «Манчестер Юнайтед». В игре с «Портсмутом» Аршавин вышел в качестве капитана команды. Матч окончился победой «канониров» (0:3).

8 мая 2009 года был признан лучшим игроком английской Премьер-лиги в апреле. Аршавин стал вторым российским легионером, когда-либо получавшим эту награду. До него такой чести был удостоен Андрей Канчельскис в апреле 1996 года.

В мае 2009 года Аршавин заявил, что он неприятно удивлён высокими ставками налогообложения в Англии: «Есть проблемы с моим контрактом. Некоторые нюансы, связанные с налогообложением и некоторыми другими вещами. В результате я зарабатываю меньше, чем рассчитывал. Это некритично, но хотелось бы привести все в порядок. И сейчас мой агент разбирается с этим».[5]

27 мая 2009 года Аршавин вернулся в расположение «петербургского Зенита», чтобы поддерживать форму до начала тренировочного цикла сборной России.